MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 chromosome

Total Repeats: 78728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019793	GCG	4	12	217	228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217736
2	NC_019793	GTC	2	6	316	321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217736
3	NC_019793	ATCCTG	2	12	586	597	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429217737
4	NC_019793	CAT	2	6	682	687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217737
5	NC_019793	CTCA	2	8	691	698	25 %	25 %	0 %	50 %	429217737
6	NC_019793	TGA	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429217737
7	NC_019793	CACG	2	8	811	818	25 %	0 %	25 %	50 %	429217737
8	NC_019793	AC	3	6	834	839	50 %	0 %	0 %	50 %	429217737
9	NC_019793	GAACA	2	10	925	934	60 %	0 %	20 %	20 %	429217737
10	NC_019793	CCT	2	6	972	977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217737
11	NC_019793	CGC	2	6	1039	1044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217737
12	NC_019793	TCC	2	6	1046	1051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217737
13	NC_019793	GGCG	2	8	1065	1072	0 %	0 %	75 %	25 %	429217737
14	NC_019793	C	6	6	1138	1143	0 %	0 %	0 %	100 %	429217737
15	NC_019793	AGC	2	6	1314	1319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217738
16	NC_019793	CTG	2	6	1403	1408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217738
17	NC_019793	ACG	2	6	1449	1454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217738
18	NC_019793	GAG	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217738
19	NC_019793	TCG	2	6	1576	1581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217738
20	NC_019793	GAG	2	6	1691	1696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217738
21	NC_019793	TGG	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217738
22	NC_019793	GTCG	2	8	1840	1847	0 %	25 %	50 %	25 %	429217738
23	NC_019793	ACG	2	6	1922	1927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217739
24	NC_019793	TGC	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217739
25	NC_019793	GC	3	6	1944	1949	0 %	0 %	50 %	50 %	429217739
26	NC_019793	CTGG	2	8	1950	1957	0 %	25 %	50 %	25 %	429217739
27	NC_019793	GCC	2	6	2002	2007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217739
28	NC_019793	CTG	2	6	2047	2052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217739
29	NC_019793	CTC	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217739
30	NC_019793	CCCA	2	8	2074	2081	25 %	0 %	0 %	75 %	429217739
31	NC_019793	GCC	2	6	2108	2113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217739
32	NC_019793	GAA	2	6	2161	2166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429217739
33	NC_019793	CCG	2	6	2180	2185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217739
34	NC_019793	GAC	2	6	2209	2214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217739
35	NC_019793	GC	3	6	2254	2259	0 %	0 %	50 %	50 %	429217739
36	NC_019793	GCG	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217739
37	NC_019793	GC	3	6	2299	2304	0 %	0 %	50 %	50 %	429217739
38	NC_019793	GC	3	6	2331	2336	0 %	0 %	50 %	50 %	429217739
39	NC_019793	CG	3	6	2433	2438	0 %	0 %	50 %	50 %	429217739
40	NC_019793	GCG	2	6	2462	2467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217739
41	NC_019793	ACG	2	6	3718	3723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
42	NC_019793	CTG	3	9	3801	3809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217740
43	NC_019793	GCA	2	6	3834	3839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
44	NC_019793	ACG	2	6	3928	3933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
45	NC_019793	CCG	2	6	3979	3984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
46	NC_019793	CTG	2	6	4029	4034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217740
47	NC_019793	CAT	2	6	4037	4042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217740
48	NC_019793	GGCGT	2	10	4056	4065	0 %	20 %	60 %	20 %	429217740
49	NC_019793	CGC	2	6	4272	4277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
50	NC_019793	AAC	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429217740
51	NC_019793	TCG	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217740
52	NC_019793	GCC	2	6	4370	4375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
53	NC_019793	GC	3	6	4387	4392	0 %	0 %	50 %	50 %	429217740
54	NC_019793	GTG	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217740
55	NC_019793	GTG	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217740
56	NC_019793	ATC	2	6	4470	4475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217740
57	NC_019793	GAG	2	6	4476	4481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217740
58	NC_019793	GCGG	2	8	4536	4543	0 %	0 %	75 %	25 %	429217740
59	NC_019793	CGC	2	6	4562	4567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
60	NC_019793	AGCC	2	8	4579	4586	25 %	0 %	25 %	50 %	429217740
61	NC_019793	CGA	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
62	NC_019793	ACC	2	6	4636	4641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217740
63	NC_019793	CGC	2	6	4658	4663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
64	NC_019793	GCG	2	6	4670	4675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
65	NC_019793	GAG	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217740
66	NC_019793	CAC	2	6	4758	4763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217740
67	NC_019793	GCG	2	6	4782	4787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
68	NC_019793	CGA	2	6	4862	4867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
69	NC_019793	GAC	2	6	4920	4925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
70	NC_019793	TCA	2	6	4966	4971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217740
71	NC_019793	GGC	2	6	4980	4985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
72	NC_019793	GCG	2	6	5090	5095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
73	NC_019793	GC	3	6	5097	5102	0 %	0 %	50 %	50 %	429217740
74	NC_019793	GGC	2	6	5112	5117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
75	NC_019793	CCT	2	6	5286	5291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217740
76	NC_019793	GCC	2	6	5317	5322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
77	NC_019793	CGA	2	6	5366	5371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
78	NC_019793	ACA	2	6	5398	5403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429217740
79	NC_019793	CGA	2	6	5420	5425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
80	NC_019793	GCC	2	6	5428	5433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
81	NC_019793	CCG	2	6	5465	5470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
82	NC_019793	TCA	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217740
83	NC_019793	CCGGCC	2	12	5509	5520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
84	NC_019793	GAC	2	6	5598	5603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
85	NC_019793	TC	3	6	5619	5624	0 %	50 %	0 %	50 %	429217740
86	NC_019793	CGA	2	6	5675	5680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
87	NC_019793	GCTC	2	8	5681	5688	0 %	25 %	25 %	50 %	429217740
88	NC_019793	GCC	2	6	5782	5787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
89	NC_019793	CGCTGG	2	12	5824	5835	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	429217740
90	NC_019793	GGACA	2	10	5880	5889	40 %	0 %	40 %	20 %	429217740
91	NC_019793	CGAG	2	8	5900	5907	25 %	0 %	50 %	25 %	429217740
92	NC_019793	GGC	2	6	5912	5917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
93	NC_019793	ACC	2	6	5918	5923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217740
94	NC_019793	AAC	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429217740
95	NC_019793	GCC	2	6	6119	6124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217741
96	NC_019793	GCG	2	6	6203	6208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
97	NC_019793	GCG	2	6	6213	6218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
98	NC_019793	GGC	2	6	6236	6241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
99	NC_019793	GCG	2	6	6268	6273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
100	NC_019793	GAG	2	6	6275	6280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217741
101	NC_019793	GCG	2	6	6324	6329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
102	NC_019793	CGG	2	6	6358	6363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
103	NC_019793	GCT	3	9	6388	6396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217741
104	NC_019793	CGCGCT	2	12	6409	6420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	429217741
105	NC_019793	GAG	2	6	6452	6457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217741
106	NC_019793	GC	3	6	6478	6483	0 %	0 %	50 %	50 %	429217741
107	NC_019793	CG	3	6	6528	6533	0 %	0 %	50 %	50 %	429217741
108	NC_019793	GATTC	2	10	6587	6596	20 %	40 %	20 %	20 %	429217741
109	NC_019793	CGG	2	6	6628	6633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
110	NC_019793	CG	4	8	6669	6676	0 %	0 %	50 %	50 %	429217741
111	NC_019793	GGTC	2	8	6706	6713	0 %	25 %	50 %	25 %	429217741
112	NC_019793	AAG	2	6	6723	6728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429217741
113	NC_019793	TCG	2	6	6762	6767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217741
114	NC_019793	GTCG	2	8	6787	6794	0 %	25 %	50 %	25 %	429217741
115	NC_019793	CTG	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217741
116	NC_019793	CTG	2	6	6900	6905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217741
117	NC_019793	GTG	2	6	6944	6949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217741
118	NC_019793	GCC	2	6	6950	6955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217741
119	NC_019793	CCGC	2	8	6970	6977	0 %	0 %	25 %	75 %	429217741
120	NC_019793	TGC	2	6	6978	6983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217741
121	NC_019793	CGG	2	6	7028	7033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
122	NC_019793	GTG	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217741
123	NC_019793	GTG	2	6	7067	7072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217741
124	NC_019793	GCG	2	6	7087	7092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
125	NC_019793	CCG	2	6	7221	7226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217741
126	NC_019793	GCGCC	2	10	7288	7297	0 %	0 %	40 %	60 %	429217741
127	NC_019793	GAA	2	6	7298	7303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429217741
128	NC_019793	GCCGG	2	10	7308	7317	0 %	0 %	60 %	40 %	429217741
129	NC_019793	GCC	2	6	7336	7341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217741
130	NC_019793	AGC	2	6	7364	7369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217741
131	NC_019793	GC	3	6	7561	7566	0 %	0 %	50 %	50 %	429217742
132	NC_019793	TGG	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217742
133	NC_019793	CTT	2	6	7599	7604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429217742
134	NC_019793	CGG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217742
135	NC_019793	GCT	3	9	7730	7738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217742
136	NC_019793	TGC	2	6	7744	7749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217742
137	NC_019793	CTG	2	6	7758	7763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217742
138	NC_019793	TCA	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217742
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141	NC_019793	CTG	2	6	7983	7988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217742
142	NC_019793	CAG	2	6	8331	8336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217742
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144	NC_019793	GCCCG	2	10	8469	8478	0 %	0 %	40 %	60 %	429217742
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151	NC_019793	GACC	2	8	8719	8726	25 %	0 %	25 %	50 %	429217743
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156	NC_019793	TGGG	2	8	8879	8886	0 %	25 %	75 %	0 %	429217743
157	NC_019793	GC	4	8	8933	8940	0 %	0 %	50 %	50 %	429217743
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261	NC_019793	CGGGC	2	10	14028	14037	0 %	0 %	60 %	40 %	429217747
262	NC_019793	CGA	2	6	14039	14044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217747
263	NC_019793	GGC	3	9	14428	14436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217747
264	NC_019793	GC	3	6	14435	14440	0 %	0 %	50 %	50 %	429217747
265	NC_019793	CG	3	6	14469	14474	0 %	0 %	50 %	50 %	429217747
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375	NC_019793	GTG	2	6	18978	18983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217751
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380	NC_019793	GGCA	2	8	19486	19493	25 %	0 %	50 %	25 %	429217752
381	NC_019793	GGC	2	6	19496	19501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217752
382	NC_019793	CCGTC	2	10	19505	19514	0 %	20 %	20 %	60 %	429217752
383	NC_019793	GCT	2	6	19531	19536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217752
384	NC_019793	GTC	2	6	19574	19579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217752
385	NC_019793	TCA	2	6	19626	19631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217752
386	NC_019793	GCAG	2	8	19634	19641	25 %	0 %	50 %	25 %	429217752
387	NC_019793	TGC	2	6	19683	19688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217752
388	NC_019793	CGC	2	6	19724	19729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217752
389	NC_019793	GGCGG	2	10	19784	19793	0 %	0 %	80 %	20 %	429217752
390	NC_019793	ACA	2	6	19828	19833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429217752
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